Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trip13Q3UA06 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip13Q3UA06 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip13Q3UA06 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip13Q3UA06 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip13Q3UA06 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip13Q3UA06 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip13Q3UA06 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip13Q3UA06 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip13Q3UA06 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip13Q3UA06 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip13Q3UA06 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip13Q3UA06 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip13Q3UA06 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip13Q3UA06 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip13Q3UA06 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms