Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops9Q3U898 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms