Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VwceQ3U515 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VwceQ3U515 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VwceQ3U515 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms