Protein–RNA interactions for Protein: Q3U132

Tespa1, Protein TESPA1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tespa1Q3U132 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tespa1Q3U132 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tespa1Q3U132 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tespa1Q3U132 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tespa1Q3U132 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms