Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KhsrpQ3U0V1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KhsrpQ3U0V1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KhsrpQ3U0V1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KhsrpQ3U0V1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KhsrpQ3U0V1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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