Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl4Q3TZA2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkl4Q3TZA2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkl4Q3TZA2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkl4Q3TZA2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms