Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccndbp1Q3TVC7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccndbp1Q3TVC7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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