Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam107bQ3TGF2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam107bQ3TGF2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam107bQ3TGF2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam107bQ3TGF2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms