Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRFIP1Q32MZ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRFIP1Q32MZ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LRRFIP1Q32MZ4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRFIP1Q32MZ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRFIP1Q32MZ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms