Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWQ2

Nell1, Protein kinase C-binding protein NELL1, mousemouse

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Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell1Q2VWQ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nell1Q2VWQ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nell1Q2VWQ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nell1Q2VWQ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nell1Q2VWQ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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