Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbp8Q2V6D6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp8Q2V6D6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp8Q2V6D6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms