Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC96Q2M329 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC96Q2M329 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC96Q2M329 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms