Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Specc1lQ2KN98 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Specc1lQ2KN98 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Specc1lQ2KN98 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Specc1lQ2KN98 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms