Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SWI5Q1ZZU3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SWI5Q1ZZU3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SWI5Q1ZZU3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SWI5Q1ZZU3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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