Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNOP1Q1ED39 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KNOP1Q1ED39 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KNOP1Q1ED39 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms