Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RTL8BQ17RB0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTL8BQ17RB0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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