Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFA9Q16795 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFA9Q16795 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFA9Q16795 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDUFA9Q16795 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFA9Q16795 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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