Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKN3Q16667 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN3Q16667 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKN3Q16667 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN3Q16667 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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