Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
E2F4Q16254 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
E2F4Q16254 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
E2F4Q16254 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E2F4Q16254 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms