Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF56Q15929 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF56Q15929 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms