Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD8Q15843 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD8Q15843 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8Q15843 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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