Protein–RNA interactions for Protein: Q15796

SMAD2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2Q15796 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD2Q15796 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD2Q15796 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMAD2Q15796 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD2Q15796 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD2Q15796 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD2Q15796 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD2Q15796 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD2Q15796 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD2Q15796 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD2Q15796 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD2Q15796 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD2Q15796 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD2Q15796 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD2Q15796 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD2Q15796 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD2Q15796 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD2Q15796 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms