Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB30Q15771 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB30Q15771 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RAB30Q15771 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB30Q15771 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB30Q15771 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
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