Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.5 ms