Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP1Q15431 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP1Q15431 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCP1Q15431 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP1Q15431 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
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