Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RABEP1Q15276 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RABEP1Q15276 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms