Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK3Q15120 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK3Q15120 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDK3Q15120 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK3Q15120 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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