Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDK1Q15118 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDK1Q15118 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDK1Q15118 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
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