Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SETDB1Q15047 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETDB1Q15047 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SETDB1Q15047 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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