Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NCAPD2Q15021 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NCAPD2Q15021 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NCAPD2Q15021 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NCAPD2Q15021 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
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