Protein–RNA interactions for Protein: Q15018

ABRAXAS2, BRISC complex subunit Abraxas 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS2Q15018 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ABRAXAS2Q15018 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ABRAXAS2Q15018 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABRAXAS2Q15018 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ABRAXAS2Q15018 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms