Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAPTM4AQ15012 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAPTM4AQ15012 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAPTM4AQ15012 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LAPTM4AQ15012 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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