Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSPNQ14714 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSPNQ14714 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSPNQ14714 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSPNQ14714 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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