Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS1Q14691 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS1Q14691 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS1Q14691 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS1Q14691 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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