Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD9Q14511 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEDD9Q14511 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEDD9Q14511 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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