Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPRIN1Q14444 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPRIN1Q14444 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPRIN1Q14444 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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