Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UBE4AQ14139 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
UBE4AQ14139 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
UBE4AQ14139 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
UBE4AQ14139 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
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