Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC39■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CDK13Q14004 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CDK13Q14004 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CDK13Q14004 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CDK13Q14004 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
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