Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD4Q13485 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD4Q13485 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMAD4Q13485 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD4Q13485 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
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