Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA4Q13439 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA4Q13439 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA4Q13439 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA4Q13439 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA4Q13439 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA4Q13439 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA4Q13439 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA4Q13439 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA4Q13439 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA4Q13439 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA4Q13439 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA4Q13439 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA4Q13439 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA4Q13439 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA4Q13439 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA4Q13439 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA4Q13439 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA4Q13439 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA4Q13439 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA4Q13439 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA4Q13439 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms