Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MKRN4PQ13434 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKRN4PQ13434 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKRN4PQ13434 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKRN4PQ13434 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKRN4PQ13434 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKRN4PQ13434 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKRN4PQ13434 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKRN4PQ13434 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKRN4PQ13434 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKRN4PQ13434 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKRN4PQ13434 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKRN4PQ13434 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKRN4PQ13434 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MKRN4PQ13434 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MKRN4PQ13434 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
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