Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.326e-17■■■■■ 48.3
PABPC4Q13310 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.376e-17■■■■■ 48.3
PABPC4Q13310 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.832e-7■■■■■ 48.2
PABPC4Q13310 C15orf61-203ENST00000560041 744 ntTSL 325.28■■□□□ 1.642e-7■■■■■ 48.2
PABPC4Q13310 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 48.2
PABPC4Q13310 TMEM9-210ENST00000495205 971 ntTSL 515.13■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 48.2
PABPC4Q13310 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 48.2
PABPC4Q13310 TMEM101-205ENST00000589334 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 48.2
PABPC4Q13310 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.333e-12■■■■■ 48.2
PABPC4Q13310 ZBTB48-204ENST00000466813 790 ntTSL 323.45■■□□□ 1.343e-10■■■■■ 48.1
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PABPC4Q13310 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.923e-10■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.93e-10■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 ZBTB48-205ENST00000466941 523 ntTSL 220.6■□□□□ 0.893e-10■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.643e-10■■■■■ 48.1
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PABPC4Q13310 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.63e-10■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 ZBTB48-206ENST00000482360 2484 ntTSL 1 (best)18.5■□□□□ 0.553e-10■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 ZBTB48-208ENST00000498342 2461 ntTSL 216.75■□□□□ 0.273e-10■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 IQCB1-203ENST00000393650 2253 ntTSL 516.64■□□□□ 0.253e-10■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.063e-10■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.073e-10■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.223e-10■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.283e-10■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 IQCB1-201ENST00000310864 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.383e-10■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 POLR3E-213ENST00000565117 1549 ntTSL 29.72□□□□□ -0.853e-10■■■■■ 48.1
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PABPC4Q13310 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.563e-10■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 IQGAP1-204ENST00000558957 2313 ntTSL 24.29□□□□□ -1.726e-15■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.221e-21■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 MIEF1-205ENST00000433117 3838 ntTSL 1 (best)13.56□□□□□ -0.241e-21■■■■■ 48.1
PABPC4Q13310 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 47.8
PABPC4Q13310 RPN2-204ENST00000437329 520 ntTSL 313.97□□□□□ -0.171e-9■■■■■ 47.8
PABPC4Q13310 RPN2-206ENST00000456400 453 ntTSL 35.62□□□□□ -1.511e-9■■■■■ 47.8
PABPC4Q13310 RPN2-208ENST00000470352 511 ntTSL 214.46□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 47.7
PABPC4Q13310 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.113e-15■■■■■ 47.5
PABPC4Q13310 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.393e-15■■■■■ 47.5
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PABPC4Q13310 RBFOX2-202ENST00000359369 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.463e-15■■■■■ 47.5
PABPC4Q13310 RBFOX2-204ENST00000397305 759 ntTSL 511.99□□□□□ -0.493e-15■■■■■ 47.5
PABPC4Q13310 RBFOX2-213ENST00000491982 1004 ntTSL 29.54□□□□□ -0.883e-15■■■■■ 47.5
PABPC4Q13310 RBFOX2-206ENST00000408983 663 ntTSL 39.43□□□□□ -0.93e-15■■■■■ 47.5
PABPC4Q13310 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.973e-15■■■■■ 47.5
PABPC4Q13310 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.038e-19■■■■■ 47.4
PABPC4Q13310 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.898e-19■■■■■ 47.4
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PABPC4Q13310 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.335e-11■■■■■ 47.4
PABPC4Q13310 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.195e-11■■■■■ 47.4
PABPC4Q13310 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.023e-7■■■■■ 47.3
PABPC4Q13310 PNCK-221ENST00000466074 1564 ntTSL 223.59■■□□□ 1.373e-7■■■■■ 47.3
PABPC4Q13310 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.243e-7■■■■■ 47.3
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PABPC4Q13310 PNCK-213ENST00000438984 326 ntTSL 321.82■■□□□ 1.083e-7■■■■■ 47.3
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PABPC4Q13310 PNCK-224ENST00000472324 2143 ntTSL 1 (best)19.55■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 47.3
PABPC4Q13310 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.673e-7■■■■■ 47.3
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PABPC4Q13310 FAM216A-203ENST00000546396 792 ntTSL 55.84□□□□□ -1.473e-14■■■■■ 47.3
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PABPC4Q13310 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.842e-12■■■■■ 47.3
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PABPC4Q13310 SIGIRR-209ENST00000527295 1867 ntTSL 222.32■■□□□ 1.164e-7■■■■■ 47.2
PABPC4Q13310 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 47.2
PABPC4Q13310 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 47.2
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PABPC4Q13310 TCF19-202ENST00000376257 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.492e-9■■■■■ 47
PABPC4Q13310 TCF19-204ENST00000542218 805 ntTSL 36.39□□□□□ -1.392e-9■■■■■ 47
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PABPC4Q13310 IMPG1-204ENST00000611179 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.855e-9■■■■■ 46.9
PABPC4Q13310 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.175e-9■■■■■ 46.9
PABPC4Q13310 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.953e-8■■■■■ 46.9
PABPC4Q13310 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.243e-8■■■■■ 46.9
PABPC4Q13310 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.115e-13■■■■■ 46.9
PABPC4Q13310 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.785e-13■■■■■ 46.9
PABPC4Q13310 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.225e-13■■■■■ 46.9
PABPC4Q13310 MTHFD2-205ENST00000470592 1396 ntTSL 210.38□□□□□ -0.751e-10■■■■■ 46.9
PABPC4Q13310 MTHFD2-208ENST00000489041 1135 ntTSL 210.1□□□□□ -0.791e-10■■■■■ 46.9
PABPC4Q13310 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.881e-10■■■■■ 46.8
PABPC4Q13310 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.391e-10■■■■■ 46.8
PABPC4Q13310 DENND1A-206ENST00000473039 4800 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.411e-10■■■■■ 46.8
PABPC4Q13310 DENND1A-208ENST00000475421 537 ntTSL 26.61□□□□□ -1.351e-10■■■■■ 46.8
PABPC4Q13310 PRDX4-204ENST00000439422 554 ntTSL 36.27□□□□□ -1.417e-8■■■■■ 46.7
PABPC4Q13310 YY1-204ENST00000554579 826 ntTSL 27.18□□□□□ -1.263e-82■■■■■ 46.7
PABPC4Q13310 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.427e-9■■■■■ 46.6
PABPC4Q13310 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.257e-9■■■■■ 46.6
PABPC4Q13310 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 46.6
PABPC4Q13310 APOC1-206ENST00000590334 508 ntTSL 514.09□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 46.6
PABPC4Q13310 APOC1-203ENST00000588802 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 46.6
PABPC4Q13310 APOC1-205ENST00000589781 273 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 46.6
PABPC4Q13310 APOC1-201ENST00000586638 425 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.592e-8■■■■■ 46.6
PABPC4Q13310 APOC1-207ENST00000592176 514 ntTSL 511.36□□□□□ -0.592e-8■■■■■ 46.6
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