Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC41.14■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC41.09■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
GRIN2AQ12879 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
GRIN2AQ12879 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC41■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC40.99■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
GRIN2AQ12879 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
GRIN2AQ12879 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
GRIN2AQ12879 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
GRIN2AQ12879 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
GRIN2AQ12879 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
GRIN2AQ12879 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
GRIN2AQ12879 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
GRIN2AQ12879 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
GRIN2AQ12879 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
GRIN2AQ12879 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms