Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH17Q12864 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH17Q12864 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH17Q12864 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH17Q12864 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH17Q12864 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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