Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
HMGXB3Q12766 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
HMGXB3Q12766 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
HMGXB3Q12766 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
HMGXB3Q12766 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
HMGXB3Q12766 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
HMGXB3Q12766 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
HMGXB3Q12766 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
HMGXB3Q12766 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
HMGXB3Q12766 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
HMGXB3Q12766 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
HMGXB3Q12766 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
HMGXB3Q12766 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
HMGXB3Q12766 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
HMGXB3Q12766 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
HMGXB3Q12766 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
HMGXB3Q12766 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC44.92■■■■■ 4.78
HMGXB3Q12766 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
HMGXB3Q12766 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
HMGXB3Q12766 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
HMGXB3Q12766 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
HMGXB3Q12766 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
HMGXB3Q12766 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
HMGXB3Q12766 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
HMGXB3Q12766 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
HMGXB3Q12766 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC44.87■■■■■ 4.77
HMGXB3Q12766 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
HMGXB3Q12766 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
HMGXB3Q12766 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
HMGXB3Q12766 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
HMGXB3Q12766 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
HMGXB3Q12766 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
HMGXB3Q12766 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
HMGXB3Q12766 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
HMGXB3Q12766 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
HMGXB3Q12766 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
HMGXB3Q12766 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
HMGXB3Q12766 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC44.81■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
HMGXB3Q12766 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
HMGXB3Q12766 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
HMGXB3Q12766 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
HMGXB3Q12766 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
HMGXB3Q12766 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
HMGXB3Q12766 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
HMGXB3Q12766 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
HMGXB3Q12766 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
HMGXB3Q12766 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
HMGXB3Q12766 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
HMGXB3Q12766 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
HMGXB3Q12766 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
HMGXB3Q12766 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.74
HMGXB3Q12766 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
HMGXB3Q12766 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
HMGXB3Q12766 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
HMGXB3Q12766 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
HMGXB3Q12766 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
HMGXB3Q12766 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
HMGXB3Q12766 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
HMGXB3Q12766 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
HMGXB3Q12766 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
HMGXB3Q12766 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC44.6■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
HMGXB3Q12766 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
HMGXB3Q12766 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
HMGXB3Q12766 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
HMGXB3Q12766 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
HMGXB3Q12766 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
HMGXB3Q12766 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
HMGXB3Q12766 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
HMGXB3Q12766 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC44.55■■■■■ 4.72
HMGXB3Q12766 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
HMGXB3Q12766 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
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