Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 YDL172CYDL172C 480 nt10.42□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 ZRT2YLR130C 1269 nt10.42□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 SNN1YNL086W 309 nt10.42□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 VPS24YKL041W 675 nt10.42□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 SGF29YCL010C 780 nt10.42□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 ADE2YOR128C 1716 nt10.41□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 YRB2YIL063C 984 nt10.41□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 RPL31BYLR406C 342 nt10.41□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt10.4□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 YDL218WYDL218W 954 nt10.38□□□□□ -0.75
TY1B-GR3Q12316 ERP5YHR110W 639 nt10.38□□□□□ -0.75
TY1B-GR3Q12316 YNL200CYNL200C 741 nt10.38□□□□□ -0.75
TY1B-GR3Q12316 ENV7YPL236C 1095 nt10.38□□□□□ -0.75
TY1B-GR3Q12316 DOT1YDR440W 1749 nt10.37□□□□□ -0.75
TY1B-GR3Q12316 MSS51YLR203C 1311 nt10.37□□□□□ -0.75
TY1B-GR3Q12316 KSH1YNL024C-A 219 nt10.37□□□□□ -0.75
TY1B-GR3Q12316 RTC2YBR147W 891 nt10.36□□□□□ -0.75
TY1B-GR3Q12316 SIT4YDL047W 936 nt10.35□□□□□ -0.75
TY1B-GR3Q12316 MSO1YNR049C 633 nt10.35□□□□□ -0.75
TY1B-GR3Q12316 YBL113CYBL113C 2379 nt10.35□□□□□ -0.75
TY1B-GR3Q12316 MTF2YDL044C 1323 nt10.35□□□□□ -0.75
TY1B-GR3Q12316 YLR126CYLR126C 756 nt10.34□□□□□ -0.75
TY1B-GR3Q12316 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt10.32□□□□□ -0.76
TY1B-GR3Q12316 YDR327WYDR327W 327 nt10.31□□□□□ -0.76
TY1B-GR3Q12316 PSR2YLR019W 1194 nt10.31□□□□□ -0.76
TY1B-GR3Q12316 YGL260WYGL260W 231 nt10.31□□□□□ -0.76
TY1B-GR3Q12316 DFM1YDR411C 1026 nt10.3□□□□□ -0.76
TY1B-GR3Q12316 VBA5YKR105C 1749 nt10.3□□□□□ -0.76
TY1B-GR3Q12316 ERG1YGR175C 1491 nt10.29□□□□□ -0.76
TY1B-GR3Q12316 SNF7YLR025W 723 nt10.29□□□□□ -0.76
TY1B-GR3Q12316 DIA4YHR011W 1341 nt10.29□□□□□ -0.76
TY1B-GR3Q12316 NUP57YGR119C 1626 nt10.29□□□□□ -0.76
TY1B-GR3Q12316 SHP1YBL058W 1272 nt10.29□□□□□ -0.76
TY1B-GR3Q12316 RPN11YFR004W 921 nt10.28□□□□□ -0.76
TY1B-GR3Q12316 SDH4YDR178W 546 nt10.27□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 PHO85YPL031C 918 nt10.27□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 DOT5YIL010W 648 nt10.26□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 PPH22YDL188C 1134 nt10.26□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 YHK8YHR048W 1545 nt10.25□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 CBR1YIL043C 855 nt10.25□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 SCS7YMR272C 1155 nt10.24□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 PRY3YJL078C 2646 nt10.24□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 NHA1YLR138W 2958 nt10.23□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 RUP1YOR138C 2016 nt10.23□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 RSC30YHR056C 2652 nt10.22□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 MRPS12YNR036C 462 nt10.22□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 DID2YKR035W-A 615 nt10.21□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 SWD1YAR003W 1281 nt10.21□□□□□ -0.77
TY1B-GR3Q12316 RPL10YLR075W 666 nt10.21□□□□□ -0.78
TY1B-GR3Q12316 GON7YJL184W 372 nt10.2□□□□□ -0.78
TY1B-GR3Q12316 GCV3YAL044C 513 nt10.2□□□□□ -0.78
TY1B-GR3Q12316 COQ1YBR003W 1422 nt10.2□□□□□ -0.78
TY1B-GR3Q12316 AMN1YBR158W 1650 nt10.2□□□□□ -0.78
TY1B-GR3Q12316 TCB1YOR086C 3561 nt10.19□□□□□ -0.78
TY1B-GR3Q12316 PTC3YBL056W 1407 nt10.19□□□□□ -0.78
TY1B-GR3Q12316 MNS1YJR131W 1650 nt10.19□□□□□ -0.78
TY1B-GR3Q12316 MLS1YNL117W 1665 nt10.18□□□□□ -0.78
TY1B-GR3Q12316 IRC5YFR038W 2562 nt10.17□□□□□ -0.78
TY1B-GR3Q12316 PTC4YBR125C 1182 nt10.16□□□□□ -0.78
TY1B-GR3Q12316 CCT8YJL008C 1707 nt10.16□□□□□ -0.78
TY1B-GR3Q12316 TIM22YDL217C 624 nt10.14□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 BUD32YGR262C 786 nt10.14□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 EXG2YDR261C 1689 nt10.14□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 HEM2YGL040C 1029 nt10.13□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 SKG1YKR100C 1068 nt10.13□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 RVB2YPL235W 1416 nt10.12□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 DUR3YHL016C 2208 nt10.12□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 YDR015CYDR015C 240 nt10.12□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 YGR054WYGR054W 1929 nt10.11□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 MSG5YNL053W 1470 nt10.11□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 UTP4YDR324C 2331 nt10.11□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 SGF73YGL066W 1974 nt10.1□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 RSC9YML127W 1746 nt10.1□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 HBS1YKR084C 1836 nt10.1□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 SRL2YLR082C 1179 nt10.1□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 YSC83YHR017W 1158 nt10.09□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 YMR034CYMR034C 1305 nt10.09□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 URH1YDR400W 1023 nt10.09□□□□□ -0.79
TY1B-GR3Q12316 MTC2YKL098W 1074 nt10.08□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 GLC8YMR311C 690 nt10.08□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 ATP10YLR393W 840 nt10.07□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 YNL285WYNL285W 372 nt10.07□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 MDH2YOL126C 1134 nt10.07□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 TSR3YOR006C 942 nt10.06□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 AAT2YLR027C 1257 nt10.05□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 CDC19YAL038W 1503 nt10.05□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 MRPS28YDR337W 861 nt10.04□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 SPT3YDR392W 1014 nt10.04□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 RPE1YJL121C 717 nt10.04□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 POX1YGL205W 2247 nt10.04□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 FCP1YMR277W 2199 nt10.04□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 ARE2YNR019W 1929 nt10.03□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 PPM2YOL141W 2088 nt10.03□□□□□ -0.8
TY1B-GR3Q12316 ECM14YHR132C 1293 nt10.02□□□□□ -0.81
TY1B-GR3Q12316 HST3YOR025W 1344 nt10.02□□□□□ -0.81
TY1B-GR3Q12316 KTR3YBR205W 1215 nt10.01□□□□□ -0.81
TY1B-GR3Q12316 HEL2YDR266C 1920 nt10.01□□□□□ -0.81
TY1B-GR3Q12316 CDC23YHR166C 1881 nt10□□□□□ -0.81
TY1B-GR3Q12316 GNA1YFL017C 480 nt10□□□□□ -0.81
TY1B-GR3Q12316 LYS1YIR034C 1122 nt10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.1 ms