Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 MRPL19YNL185C 477 nt7.85□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 REG2YBR050C 1017 nt7.85□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 CDC23YHR166C 1881 nt7.84□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 THR1YHR025W 1074 nt7.84□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 FAF1YIL019W 1041 nt7.84□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 IDP3YNL009W 1263 nt7.84□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 ASR1YPR093C 867 nt7.84□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 COG1YGL223C 1254 nt7.83□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 YLL056CYLL056C 897 nt7.83□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 SUN4YNL066W 1263 nt7.83□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 MHP1YJL042W 4197 nt7.82□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 ARA2YMR041C 1008 nt7.82□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 FMP40YPL222W 2067 nt7.82□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 LCP5YER127W 1074 nt7.81□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 YGL102CYGL102C 429 nt7.81□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 YAL045CYAL045C 309 nt7.81□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 YKR018CYKR018C 2178 nt7.81□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 SGV1YPR161C 1974 nt7.8□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 CAN1YEL063C 1773 nt7.8□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 YLR122CYLR122C 378 nt7.8□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 YPL136WYPL136W 369 nt7.8□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 FCP1YMR277W 2199 nt7.8□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 RGT2YDL138W 2292 nt7.79□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 PTC7YHR076W 1032 nt7.79□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 AIM20YIL158W 615 nt7.79□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 SGE1YPR198W 1632 nt7.78□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 IMG1YCR046C 510 nt7.78□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 YPR127WYPR127W 1038 nt7.78□□□□□ -1.16
CLF1Q12309 AQR1YNL065W 1761 nt7.77□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 HPT1YDR399W 666 nt7.77□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 URH1YDR400W 1023 nt7.77□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 LCL3YGL085W 825 nt7.77□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 POR2YIL114C 846 nt7.77□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 YTH1YPR107C 627 nt7.77□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 NUP49YGL172W 1419 nt7.77□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 DAL4YIR028W 1908 nt7.76□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 RPL2BYIL018W 765 nt7.76□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 PHO85YPL031C 918 nt7.76□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 NUP57YGR119C 1626 nt7.76□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 POB3YML069W 1659 nt7.76□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 TAF9YMR236W 474 nt7.75□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 SMX3YPR182W 261 nt7.75□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 GPA1YHR005C 1419 nt7.75□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 ACO1YLR304C 2337 nt7.74□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 CTA1YDR256C 1548 nt7.74□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 ICP55YER078C 1536 nt7.74□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 YER137CYER137C 447 nt7.74□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.74□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 MRPS18YNL306W 654 nt7.74□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 DLD1YDL174C 1764 nt7.74□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 PMP3YDR276C 168 nt7.73□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 OPI7YDR360W 435 nt7.73□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 ASF1YJL115W 840 nt7.73□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 REC107YJR021C 945 nt7.73□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 CRH1YGR189C 1524 nt7.73□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 PRI1YIR008C 1230 nt7.72□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 YOR300WYOR300W 309 nt7.72□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 ILV6YCL009C 930 nt7.72□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 EXG2YDR261C 1689 nt7.72□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 VBA5YKR105C 1749 nt7.72□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 YLL058WYLL058W 1728 nt7.72□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 MSC3YLR219W 2187 nt7.71□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 FCY2YER056C 1602 nt7.71□□□□□ -1.17
CLF1Q12309 SAL1YNL083W 1485 nt7.71□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.71□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 FLC2YAL053W 2352 nt7.71□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 GAL83YER027C 1254 nt7.7□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 MIX17YMR002W 471 nt7.7□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 PRB1YEL060C 1908 nt7.7□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 SEC24YIL109C 2781 nt7.7□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 RMD8YFR048W 1989 nt7.7□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 AIM3YBR108W 2844 nt7.69□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 FMO1YHR176W 1299 nt7.69□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 RMA1YKL132C 1293 nt7.69□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 YLR184WYLR184W 348 nt7.69□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 SCS22YBL091C-A 528 nt7.69□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 LSC1YOR142W 990 nt7.69□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 IRC5YFR038W 2562 nt7.69□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 EDC3YEL015W 1656 nt7.68□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 YKL153WYKL153W 510 nt7.68□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 BNA3YJL060W 1335 nt7.68□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.67□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 MRPS28YDR337W 861 nt7.66□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 RPL31BYLR406C 342 nt7.66□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 SPG5YMR191W 1122 nt7.66□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 YMR034CYMR034C 1305 nt7.66□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 GCG1YER163C 699 nt7.65□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 SWD1YAR003W 1281 nt7.65□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 MSG5YNL053W 1470 nt7.65□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 VTS1YOR359W 1572 nt7.65□□□□□ -1.18
CLF1Q12309 TDP1YBR223C 1635 nt7.64□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 TOD6YBL054W 1578 nt7.64□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 HED1YDR014W-A 489 nt7.64□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 YHC3YJL059W 1227 nt7.64□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 YKL102CYKL102C 306 nt7.64□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 RNH1YMR234W 1047 nt7.64□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 KDX1YKL161C 1302 nt7.63□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 YCR041WYCR041W 333 nt7.63□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 HGH1YGR187C 1185 nt7.63□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 MDH1YKL085W 1005 nt7.63□□□□□ -1.19
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