Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppp4r2Q0VGB7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppp4r2Q0VGB7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ppp4r2Q0VGB7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppp4r2Q0VGB7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppp4r2Q0VGB7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppp4r2Q0VGB7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppp4r2Q0VGB7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp4r2Q0VGB7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp4r2Q0VGB7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp4r2Q0VGB7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppp4r2Q0VGB7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppp4r2Q0VGB7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppp4r2Q0VGB7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms