Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem52bQ0VBF2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem52bQ0VBF2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem52bQ0VBF2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms