Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAGPQ0VAQ4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms